サーバーに作成したMTフォルダに、CGIを書き換えたMTファイルたちをアップロードするわけですが、FFFTPを使用すると便利ですので、最初にダウンロードしておいてください。
FFFTPの使い方ですが、あなたが契約したサーバーから、おそらくFTPサーバーのパスワードやURLなどがすでに通知されているはずです。
メールボックスやアカウント情報などを確認して記入します。
うまく接続できたら、左の窓でさきほどCGIファイルなどを書き換えたファイルを探します。
デスクトップにダウンロードした場合は、Documents and Settings\Administrator\デスクトップみたいな感じでたどっていけばいいと思います。
MTフォルダがあったら開いてあげます。
右側の窓はサーバー側のフォルダ階層になってるので、作成したMTフォルダを開いてあげます。
この時点では、mtフォルダ内は空の状態です。